马本斋在军区后方医院，忍着病痛，艰难地坐在床上写战斗日记。这已经是他的老习惯了，不管环境多么残酷，工作多么繁忙，他总是挤出时间写战斗日记，从不间断。
他并不认为“年纪大了，学不进去”，而是常常因为钻研党的方针政策而废寝，更常常为了学习一些兵法，忘了吃饭的时间。他对于每一份党的文件，还有搞到的军事著作细心研读，并结合战斗实践写好日记。
每天他都亲自把一天的活动用纸条写下来，过几天，由司令部的赵寅卿拿去腾清在三十二开黑硬皮笔记本上。接近他的人都亲切地记得，每当夜深人静的时候，他还在挑灯夜读，写日记，而第二天拂晓，他又迅速起床，处理纷纭的工作。
如今，马本斋已明白自己来日无多，但是只要一息尚存，就要象以往在战场上带领战士冲锋陷阵一样与病魔死亡争夺时间，继续记录下自己的心血，留给后人。
当时，马本斋的家属也在医院照顾马本斋同志。马本斋的孩子马国超年幼，不听妈妈劝阻扑到马本斋跟前，闹着要爸爸讲战斗故事。马本斋为了不让孩子失望，仍强打起精神，拉着孩子的手一起唱“抗日战士出征歌”。
这时，马本斋病情恶化，已转成肺炎，连连咳嗽，唱几句，停下来，再喘着粗气说：“没关系，轻伤不下火线。来，爸爸再和你一起唱。”
妈妈催促着孩子快快离去，而马国超不愿意离开平常很少见面的爸爸。马本斋拉着孩子的手问：“爸爸教你的两个字学会了吗？”马国超说：“会了”，拿着铅笔在纸上歪歪斜斜地写了“中国”两个字。
马本斋满意地微笑着说：“孩子，记住，我们的祖国就叫中国，没有**就没有新中国！”他给孩子幼小的心灵里，循循善诱地进行着热爱伟大祖国和中国**的最早启蒙。
这时，回民支队接到奔赴陕甘宁边区保卫延安的命令，政委到医院看望马本斋同志。马本斋忍着病痛开玩笑说：“政委同志，我到马克思那里去报到。他说，你的任务还没有完成呢，怎么就来啦？我一听，对呀，我的任务还没有完成呢，所以又回来啦！”
政委听到了马本斋的话，眼里闪动着抑制不住的泪花。
政委告诉他：“这里有一封电报？”
马本斋说：“非常抱歉，请您念给我听听吧。”
“这是从延安发来的电报！”政委兴奋地说。
马本斋一听是延安发来的电报，兴奋无比，竟出人意料地从病床上坐了起来。他用颤抖的双手拿过电报，亲自阅读，并断断续续地读道：“冀中回民支队马本斋同志；党中央问候你和全体指战员。你们以大智大勇，驰骋于华北平原，取得卓著之战绩。总部决定，命你部速来延安，接受重任……”
他梦寐以求到延安见**和朱总司令的愿望就要实现了，心情感到无比激动。他轻声反复地读着电报，消瘦的脸上呈现出红润和笑容。他说：“政委，党中央的电报对咱们回民鼓舞太大了。我们要坚决执行命令，尽快出发。可是动员的重任就落在你一个人的身上了。”
一月底，部队接到开赴延安的命令。出发前，杨得志司令员亲自到医院探望马本斋同志，传达中央决定。马本斋坚决要求随军出征，经杨得志再三劝说，马本斋才同意留院治疗。
他为自己不能随军西进，感到非常遗憾，难过地嘱咐回民支队的干部：“一定要坚决服从杨司令员的指挥。……你们见到**、朱总司令后，要转达我对他们的问候。”
二月一日，回民支队跟随杨得志司令员踏上了保卫延安的征途。这时马本斋同志已病危，但他的心里还在想着部队，想着抗战，时时思念着回民支队。
护理人员为了观察他病情的变化，多点了两盏棉油灯，他醒过来后，责怪护理人员不该浪费这些灯油，说：“要听**的话，节约每一个铜板，为着战争和革命事业，我这屋里有一盏灯就行了。”
马本斋生也英武，终亦壮志不灭，弥留之际，他对身边的同志说：“让部队等着我……我不行了，把我的家属送到延安去，继续革命。告诉三弟，抗战到底。”
他在临终时，向家属遗言：“我觉得，不能为人民为国家为党做更多的工作是件憾事，教孩子继续我的志向做革命工作，告三弟领导***民族抗战，革命到底！”
1944年2月7日，中国**的优秀党员，著名的中华民族英雄马本斋，以43岁的盛年，不幸与世长短辞，病逝于冀鲁豫军区医院。
当时，马本斋不幸病逝的消息传出后，引起了冀鲁豫全体军民的极大悲痛。当天军区立即根据马本斋的生前遗嘱，将其遗体送到鲁西北的回民中心地——莘县张鲁集安葬，并由军区阎参谋长，三军分区刘政委及武装部队护送。
在灵柩路过军政驻地时，区党委、行署、军区举行隆重的送灵追悼大会。军区苏政委，区党委张霖之同志，行署贾副主作亲率直属机关干部致祭。8日下午，灵柩进入鲁西朝城县境，在朝城城外休息时，很多回汉同胞都来祭吊。
他们说：“我们无法报答马司令，就让我们烧点儿纸磕个头吧，也算尽我们的心了。”
8日黄昏，灵柩到达张鲁集。霎时，噩耗传遍张鲁集与邻近村庄，祭吊的人象潮水一般涌向清真寺，直到第二天早晨没有断过。
9日上午，**代表黄敬同志，冀南行署王副