公孙轩辕出生十多天便能开口说话，少年时便显现聪明的一面，并且跟着广成子学习仙法，修炼速度极快。十几岁时就在部落树立极高的威望，并成为了部落的领袖，然后短短数年时间，就带着有熊部落发展成为了部落联盟中数一数二的大部落。
神农听完后越发觉得公孙轩辕就是第三人皇，决定亲自去见见这个公孙轩辕。神农著《神农本草经》证道在洪荒世界闹得沸沸扬扬，当他出现在有熊部落时，整个部落顿时热闹起来，公孙轩辕连忙带着部落人民拜见神农。
神农一见到公孙轩辕，便上下打量他，浓眉大眼，一脸浩然正气，年龄不大就已经显得相当稳重成熟，公孙轩辕给神农的第一印象非常不错，特别是公孙轩辕全身透露出的那股皇者风范，神农看了暗自点头称赞不已。
除了公孙轩辕外还有一人引起了神农的高度关注，乃是一位道骨仙风的老道士，神农证道后，其眼力大增，立刻感觉到这位老道士的不凡，很快就想到此人是谁，必是公孙轩辕的师傅，阐教十二金仙之首的广成子。
神农向广成子躬身行了一礼，神农现在的身份何等尊贵，业已证道，随时都能成就人皇道果，广成子哪敢受此大礼，连忙躬身回礼。神农也略微知道其中道理，没有再理会广成子，今天来的主要目的是公孙轩辕。
上前亲自扶起公孙轩辕，说道：“听闻轩辕首领乃是人族贤能之人，今日是专门前来和轩辕首领探讨问题的。”公孙轩辕听完后，想到伏羲当年拜访神农的事迹以及老师广成子说过自己可能是第三人皇的话，心中顿时明白过来，神农这次来估计是来考验自己的。
果然随后几天神农跟轩辕谈论了许多如何教化人族的问题，轩辕毫无保留说出了自己的想法，神农从中看到了轩辕的才智，对轩辕很满意，广成子也暗中向神农讲诉了轩辕从小的不凡之处，神农越发肯定了公孙轩辕为第三人皇的想法。神农与公孙轩辕商讨几天后，神农便邀请公孙轩辕和他返回陈都，帮助神农一起教化人族。公孙轩辕从小有着极大的抱负，对神农的邀请欣然接受，带着家人跟着神农回到了陈都。
回到陈都后，神农便学着伏羲那样，慢慢放权给轩辕，可是轩辕的聪慧大大超出了神农的预测，只是短短一年的时间，轩辕便完全掌握了人族共主应做之事，并且在人族高层树立绝对的威信，轩辕之名也慢慢在人族之中流传。
神农非常满意，命人安排禅位事宜，并像伏羲那样带着轩辕来到尹国的茅屋，希望尹国能在以后多指点轩辕。轩辕对于尹国这位人族圣师非常好奇的，不管是从人族的传闻还是老师广成子那里都知道尹国是位洪荒高人。特别是广成子曾告诉他，人族圣师尹国即使广成子老师玉清圣人元始天尊都无法算出其来历，而且是鸿钧道祖说的帮助人皇教化人族的天命之人，六位圣人都对他另眼相看，并吩咐门下弟子不要轻易招惹人族圣师。
当轩辕见到尹国后，顿时觉得闻名不如一见，尹国的容貌在是太年轻了，根本不像是个洪荒高人，不过这不是主要的，主要的是尹国不经意间流露出来的气质，是那么的飘渺，那么的玄奥，整个人给人一种朦胧神秘的感觉，即使见惯了广成子的轩辕，在面对尹国是依旧看之不透。
听完神农的来意后，尹国看了看轩辕笑了笑说道：“以后有什么事，我会亲自来找你的，你就不用来找我了。”神农和轩辕一听很疑惑，神农问道：“圣师这是何意？”尹国说道：“轩辕跟伏羲和你不同，当年伏羲拜太清圣人为师，我指点伏羲教化人族，太清圣人乃是圣人之尊，不会为这点小事迁怒于我，而且太清圣人也没有这么多时间帮助伏羲，我指点伏羲，太清圣人还乐的清闲。神农你没有师傅，我指点你更不会受到谁的迁怒，轩辕你不同，拜了广成子为师，你师傅乃是洪荒名人，若是我经常指点你教化人族，你师傅会怎么想，所以遇到什么困难，可先问你师傅，若依旧解决不了，我这才会出面指点你。”
神农和轩辕听完顿时明白过来，轩辕向尹国拜谢道：“多谢尹国圣师。”尹国点点头，接着和神农轩辕商议了禅位大典之事，表示和伏羲禅位时一样，依旧由他宣读禅位祭文。
半个月后，禅位大典依旧在陈都中心处的禅位祭台举行。有了上次伏羲禅位的例子，这次神农禅位之事，在准备阶段就传遍了整个人族。禅位大典那天，陈都云集了众多人族，连一些修道之人和仙人也赶了过来。
和伏羲禅位时一样，参加大典的人都围着祭台跪拜，只有神农、尹国、轩辕三人登上了祭台。这次祭台上摆放的牌位不只有鸿钧道祖和六位圣人，最后还加了一个伏羲天皇的牌位。
依旧先是尹国宣读禅位祭文，接着神农向祭台上的八位人族中最高的神明宣布了自己禅位于轩辕，最后轩辕同样向祭台上的八位人族中最高的神明表示自己愿意继承人族共主之职。
随后整个洪荒苍穹奏起仙音，降下五彩祥云，一辆驾驭着九条金龙的辇车，缓缓来到祭台之上。上面站着两人，分别是伏羲天皇陛下和三教首徒玄都大法师。