而在此期间，前方战局更是日趋恶化，先是忠勇军一路追击岳乐统率的两白旗突入江西，攻占战略要地九江，惹得两江地区（江苏、江西、安徽）一日数惊，各地反清势力再次揭竿而起，五省总督洪承畴连番告急，提出上中下三策，要求蛮清退到长江以北，实现南北分治的目标。
上策：主动放弃两广、闽浙、湖南五省，扶持广东的杜永和、广西的永历帝、福建的郑成功、浙江的舟山水师，使其分别控制江南五省，在江南形成诸侯割据的形势，而蛮清将精锐集中于两江地区（江苏、江西、安徽），以与忠勇军决一死战）。
中策：建立江南大营，江北大营，湖广大营，委以重臣统率，当忠勇军攻其一路，另外两路积极营救，使其难以集中兵力对付其中一路。而蛮清则令两广的孔有德、尚可喜、耿仲明率领主力攻占两广，令亲王博洛、闽浙总督陈锦集中主力消灭郑成功与鲁王朱以海的水师。
下策：令驻防湖广的摄政王济尔哈朗、郡王瓦克达率部北上，以突袭湖北为名牵制忠勇军，为江南大营、江北大营营建赢得时间。
多尔衮召集众人商议，范文程、宁完我则赞成上策，上策可以为蛮清赢得时间，可以让南方陷入诸侯割据的局面，但以忠勇军之强，其他各路兵马之衰弱，完成南方统一那是迟早的事情。
在统一南方之后，杨昭必然如朱元璋那样誓师北伐，如此大清还不是只有像北元那样放弃华北退回关外？
再说了放弃湖南、两广、闽浙，别的不说，单说攻占这些战略地方耗费多少人力物力，死了多少八旗勇士，现在要放弃这些地方，大家一时半刻之间怎么能够舍得呢？
而多尔衮则一直有一个梦想，那就是完成大金英雄金兀术所未完成的事业，征服中原，成为天底下唯一的皇帝。
眼看这个使命即将完成，多尔衮又怎么舍得放弃呢？
就在多尔衮左右为难，难以取舍的同时，从两广相继传来好消息，那就是经过十月围城，尚可喜终于攻占广州，孔有德率军南下攻占桂林。
听到这个消息后满朝廷大喜过望，征服华夏，一统中华的前景再次浮现曙光，在这个时候多尔衮则毫不犹豫的选择中策。
令英亲王阿济格、陕甘总督孟乔芳率领6千正白旗残部，4千蒙古骑兵与3万绿营兵马组建西路军，驻防陕西、甘肃，河南，以支援前线各部。
令平西王吴三桂，汉军镶红旗固山额真李国瀚，亲王满达海、贝勒索托、尚书明安达礼，将军塔布囊山大率领3万关宁兵马，5千汉军镶红旗，2500余名喀喇沁蒙古兵、2000名翁牛特蒙古兵与4万绿营兵马组建中路军，在南阳集结后，组建江北大营。
命摄政王济尔哈朗、安郡王瓦克达率领镶蓝旗、正红旗与湖南、两广兵马组成湖广大营。
令亲王岳乐、六省总督洪承畴，将军哈尔哈齐、副都统苏朗率领3千镶蓝旗，4千镶白旗，5千蒙古兵与5万绿营兵马组成江南大营。
多尔衮信心满满，通过四路大营将忠勇军围在西南、湖北，若忠勇军攻其一路，其他三路一起杀出，令杨昭难以专心对付其中一路。
但再完美的计划都有瑕疵，若真正等到蛮清这四大兵营建成，到那时忠勇军要破洪承畴大计必然困难重重，但现在时机不站在鞑子这边了。
在这年10月上旬，看到秋耕即将完成，杨昭也召集军事会议，商讨到底是东进江南地区还是南下湖广地区的时候，突然看到承运门前一骑翻身下马，杨昭定睛一看，来者竟然是第12镇游击将军王国玺。
在一个侍卫带领下，王国玺满脸灰尘的来到坐前，跪下大哭不已。
原来就在忠勇军攻陷武昌城的同时，尚可喜、耿仲明攻陷广州，制造了骇人听闻的广州大屠杀。
除此之外，孔有德占领桂林，南明督师瞿式耜自杀殉国。
随着鞑子相继占领广州，桂林，基本上宣布以朱由榔、杜永和为首的南明势力退出历史舞台。
原来，在永历三年（公元1649年）10月开始，伪平南王尚可喜、伪靖南王耿继茂率军杀到广州城下，广州民众在南明两广总督杜允和率领下，大家据城死守不出。
尚可喜、耿仲明最先率军攻城，但广州城墙颇为高大，再加上鞑子向来不善于攻城，经过两天厮杀，广州城内明军杀退尚可喜、耿仲明进攻，力保城门不失。
在这种情况下，尚可喜一面令人在广州城门四周广挖壕沟，将广州城团团围住，而另一方面则大规模的铸造大炮，在永历四年8月1日这天，清军集中73门火炮轰击广州城墙的西北角这一点，清军不怕疲劳、不惧炸膛的清军炮手们，竟然整整轰了一天一夜。
到第二天，奇迹终于出现了，坚固的广州城墙被轰塌一道三十余丈的大口子。苦苦等待了多时的尚可喜亲自率着清军敢死队，冲进了广州城。
如此广州失守，杜永和只得率领数千大军登上大小船只撤至海南岛的琼州。
在占领广州城后，尚可喜、耿仲明制造了骇人听闻的广州大屠杀，据意大利传教士卫匡国撰写的回忆录中记载，在这场完全是汉人屠汉人的杀戮中，共有二十多万男女老幼，悲惨地死于同族人的刀下。
与此同时，“孤胆汉奸”孔有德也从全州发起攻击，在永历4年（公元1650年）8月，孔有德率部杀向桂林，守卫桂林的就剩下曹志建和焦琏了