在杨昭大斗瘟疫的时候，会盟后的川南各地军阀也纷纷向云贵地区开去，以抢夺被流寇遗弃的地盘。
王祥最先驻军播州，只因为蛮清入侵方率部北上以阻挡鞑子，在忠勇军恢复成都府的时候本有心夺回失地，但因为自己与杨展有隙，害怕二杨合兵一处抄袭自己背后，如此按捺住冲动，屯兵川南。
在杨昭大会各路诸侯之后，王祥大喜过望，当即亲率大军南下，迅速抢占播州，贵阳府后与贵州总兵皮熊合兵一处，然后大军经过安顺府，安南卫向曲靖方向扑来
听到老冤家王祥的消息，身在建昌卫的四川行都司指挥使杨展也不甘示弱，在这年8月率兵逼近武定府。
在明朝末年，武定府土司吾必奎看到大明二京相继被李自成、鞑子所占，大明有倾覆的危险，宣称：“没有朱皇帝，何来沐公府的政治宣言，宣布起兵反对盘踞云南两百余年的黔国公沐天波这一家。
其时云南主要军队已经相继进入四川与张献忠部作战，看到吾必奎逼近云南府昆明城的时候，黔国公沐天波依靠沐家世居云南的机会，召集石屏土司龙在田，蒙自土司沙定洲，宁洲土司禄永命等势力经过鏖战平定了吾必奎叛乱。
但也因为这次行动，给沐天波带来更大灾难。
蒙自土司沙定洲表面上忠厚老实，实际上是包藏祸心的家伙。沙定洲本来为王弄土司沙源的儿子，看到阿迷州土司普名声其妻万氏成为遗孀，当即娶了大十几岁的万氏，如此王弄土司与阿迷州土司合二为一，其实力已经超过其他土司。
在平叛过程中不但看到沐天波实际上已经外强中干，而且还看到黔国公府两百余年所积累起来的巨大财富，临安府生员汤嘉宾（万氏的妹夫）为谋主，暗中筹划利用沐府同云南巡抚和三司官之间的矛盾、各土司的向背不一的情况下，在弘光帝二年（公元1645年）12月1日以告辞为名发动叛乱，率兵攻入黔国公府，而且还杀死沐天波母亲陈氏，夫人焦氏，夺取了黔国公付几百年所聚集起来的财富。
黔国公沐天波根本来不及组织有效的抵抗，在几名心腹卫士保护下带着官印、世袭铁券等物逃往楚雄府，这里有金沧兵备道杨畏知镇守，如此方的幸免。
沙定洲占领昆明以后，自称“总府”（“总府”是明黔国公世爵的一般称呼），其妻万氏称主母，夫妻并舆出入，遍谒缙绅，滇中豪右投为谋划者甚众。
然后沙定洲一面发兵取云南各地，除了在楚雄府遭到杨畏知等人抵抗之外，其他各地已经被沙定洲牢牢控制。沙定洲在永历2年（公元1646年）正月集中主力，集中了庞大兵力，分成七十二营，每七营为一大营，将楚雄层层包围。又环城立栅凿濠，不使一人潜出。
杨畏知虽竭力据守，但楚雄府毕竟是小城，双方相持八十余天，就在大家以为楚雄府即将攻破的时候孙可望率军入滇。
原来在这个时候孙可望已经率部占领播州，面对四面八方优势明军，再加上贵州贫瘠（地无三分平，天无三日晴，在二十一世纪贵州、西藏都是中国最为贫寒的地方），即使占领贵州全省也断难养活自己拿数万大军，更不能借此发展。
正在孙可望茫然无措的时候，张献忠在谷城认的干爹，也就是孙可望的干爷爷龙在田来到播州，在鞑子入川，川内明军风声鹤唳之时，过去支持沐天波平定吾必奎叛乱的石屏土司龙在田认为只有凭借外力才能够解决沙定洲叛乱，而这外力就是自己干孙子孙可望。
在张献忠在谷城受降的时候，与来自云南石屏土司龙在田关系甚佳，张献忠拜龙在田为干爷爷，在张献忠再次反叛的时候，与张献忠关系甚佳的石屏土司龙在田遭到牵连，如此方率领土司兵回到石屏老家。
现在看到叛逆沙定洲控制云南，龙在田看到了希望，单枪匹马来见自己干孙子，告诉孙可望等人云南情景，建议孙可望以沐天波妻弟焦氏的名义起兵报仇。
孙可望按照龙在田的计策，派出谍战人员潜入云南，利用黔国公的威望，散布虚假情报说，入滇的大西军，是沐天波妻子焦氏的家族武装，专门为屈死的焦氏报仇来了。请云南各界人士，各个地方，届时请自行归顺，切勿为万恶的沙定洲尽忠守节。
1647年3月25日，大西军占领平彝，打通了进入云南的前哨。28日，攻克交水，29日，进军曲靖，歼灭沙定洲守军五百名
为迷惑沙定洲，以最小的代价轻取昆明，大西军转而向沙定洲的原籍阿迷州方向移动，并在路上斩获其一千多人。
见老巢有失，顾头不顾腚的沙定洲，立即放弃昆明，全军返回蒙自以退守老家。
在完成牵敌西下后，大西军忽然回师，以迅雷不及掩耳之势，兵不血刃地进入昆明。
占领云南后，大西军的“真面目”当即被民众识破，孙可望暂时停止进攻，采取了“稳老纳新”的政策，在将部分大西军队干部“军转民”，从事地方建设的同时，也大量留用了原明朝的各级官员，使政权变动引起的震荡降到最低点。
经过3个月整顿，云南民众逐步接受了大西军这一新政权统治后，孙可望正准备率部攻打占据楚雄府的沐天波、杨畏知时南方传来消息，明军正兵分三路源源不绝的杀来。
孙可望一听大惊失色，长叹道：“各位，父皇就是因为明朝四面包围最后退出四川的，现在我等刚刚占