按新立的法典精神，鄂齐尔图车臣以及其阿巴赖，巴图尔洪台吉及其弟楚琥尔乌巴什、辉特部长苏勒旦等率部参加了联军。尔岱青特意从额济勒派出了远征军。
联军的目标就是青海。
达延汗的孙子土默特俺答汗曾经出兵青海，控制这一地区。俺答汗控制青海后，与青藏黄教首脑，时任哲蚌寺主的索南嘉措会面。
二人相见甚欢。俺答汗随即皈依索南嘉措门下，三十五岁的哲蚌活佛索南嘉措宣布他七十一岁的新弟子为“咱克喇瓦尔第彻辰汗”
“咱克喇瓦尔第”为梵语“转轮王”，“彻辰”是蒙语“聪明、智慧”之意此为蒙古贵族皈依黄教之始，从那以后。大批蒙古人开始进入西藏学经，黄教也逐渐浸入了蒙古人后来的历史。
来而不往非礼也，俺答汗遂回赠师父以“圣识一切瓦齐尔达喇da赖喇嘛”的尊号，这就是大赖喇嘛活佛系统称谓的最初由来。
这次会面是历史性的，拥有极为久远的影响。
如果说白点。这其实就是两个不同领袖的首脑搞了一个彼此间的认证。
我承认你是一个世俗领袖，你承认我是宗教领袖，双方互相捧场。
所谓“圣识一切瓦齐尔达喇大赖喇嘛”，是一个梵、蒙、藏结合的称呼，其中“瓦齐尔达喇”来自梵文，意为“执金刚”，是密宗里地位极其重要的菩萨；“大赖”是蒙语，意思是“大海”；“喇嘛”则是藏语中的“上师”。“圣识一切瓦齐尔达喇大赖喇嘛”，合起来就是“大海般渊博的执金刚上师”。
而这大海在藏语里正是嘉措的意思，与索南嘉措的名字相合。显然是俺答汗为他量身订制的。
从此，索南嘉措就成了第一位大赖喇嘛，但他往上追认了两位大赖，自称为三世大赖，实际上大赖就是自他开始。
这次的会盟，就是藏区黄教与蒙古贵族的联合，借助与俺答汗的结盟，索南嘉措巩固了自己宗教领袖的地位，虽然当时黄道还不是藏区的宗教正统，但起码他已经成了黄教的最高首脑。甚至盖过了当时的教主。
不过两人会盟后仅四年，年迈的俺答汗就去世了，强盛一时的土默特也开始走向衰弱。但黄教已经开始在蒙古生根发芽。
俺答汗死后六年，三世大赖也圆寂。
黄教集团为了能够在藏区与其它诸教争雄。便宣称俺答汗的曾孙是三世大赖的转世灵童。
藏传佛教黄教派使有了一位蒙古孩子做为大赖的转世灵童，这明显就有猫腻。
已经开始信奉黄教的蒙古人自然高兴，他们组成联军，以武力护送了灵童入藏，震慑那些对黄教不满的势力。此后，俺答汗的孙子便正式坐床拉萨。并成为了四世大赖。
不过在当时，黄教虽然日渐壮大，但最强的并不是黄教。且宗教力量之外，还存在着世俗政权，当时统治西藏的是藏巴汗家族，而藏巴汗信奉白教的一支噶吗噶举派，仇视黄教，双方的矛盾不断加剧。
后来藏巴汗毒杀了年轻的四世，还禁止大赖转世，最后还是因为黄教的高僧治好了藏巴汗的病，才允许大赖转世。
四世的转世是一名藏区六岁男孩，法名罗桑嘉措，译成汉语就是“善海”。
此后，黄教和藏巴汗都没能消灭对方，黄教在藏区民间基础越发雄厚，而藏巴汗则掌握着上层，并且双方都各有支持自己的武装，因此形成微妙平衡。
但在五年前，在五世的老师罗桑曲结的秘密邀请下，原本放牧于西域的卫拉特和硕特部首领固始汗突然率军攻入了青海。
五世赠给固始汗丹增却杰称号，意为持教法王。
固始汗有意仿效当年俺答汗之举，通过黄教大赖的封赠，加强自己的地位。他率领本部人马，加上巴图尔珲台吉的部份准噶尔军队，进入了青海，击败了盘踞在此的却图汗阿尔斯兰父子。
此后，他又进攻甘孜一带消灭了当地的白利土司，战争持续一年，固始汗占领了白利土司统治的全部地区，今四川北部的德格、甘孜、邓柯、白玉、石渠、玛尔康等部落，都成为和硕特蒙古的统治区，顾实汗俘虏并处死了顿月多吉，释放了被白利土司关在监狱里的格鲁派、萨迦派等所有喇嘛。由此，顾实汗得到了西藏各教派除苯教外全体喇嘛的钦佩和感激。
不过此时，汉军西进。
郑芝龙率领所部收复陕甘，并把青海的河湟谷地一带收复。
而张山、蔡远的部队从汉中入川，再越过大雪山，将藏区东部沿四川一带控制，并建立了西康省。
汉军的进军速度神速，大大出乎固始汗的预料，成为进入青藏的又一支强大势力。
尤其是张山所部，将甘孜等固始汗打下来的藏区东南甘孜等地给夺占，这让他正准备率军入前藏的固始汗措手不及。
固始汗一时骑虎南下，本来眼看就能一举杀进藏区，将藏巴汗歼灭，控制整个青藏，到时他扶持黄教，以黄教保护主的身份，就能成为整个青藏地区的最高统治者，形成由蒙古汗王和黄教大赖联合统治藏区的局面。
可汉军的突然西进，打破了这一局面。
汉人不但夺占了不少他打下的地盘，还新设了西康和青海二省，其野心昭然若揭，固始汗绝不能容忍自己的胜利果实成熟之际，却被汗人给摘了。