袁世凯在外务部尚书任内，做得另一件很有意义的事是禁止鸦片进入。
鸦片的传入中国，对中国的危害极大。林则徐等有识之士，为了禁止鸦片曾做出过不懈地努力，但始终没能禁住。
袁世凯任外务部尚书后，马上着手了与英国禁止鸦片进口地交涉。
经多次磋商后，于一九零七年十二月，中国外务部就禁止鸦片进口事宜致函英国驻中国使馆，明确表示，吗啡“如查有不因医治使用贩运来华者，一概不准进口”。同时表明，中国也将限制种植罂粟等作物。
经过一番努力，英国**同意从一九零八年一月开始，减少从印度运往中国的鸦片，十年内禁绝。禁止鸦片进入终于通过外交地努力，有了一次重大地进展。
后来，一九一一中英又续订条约，规定自一九一一年一月起，至一九一五年完全停止进口鸦片。祸害中国几十年的毒品，终于以条约的形式明文禁止了进口。对此，袁世凯功不可没。
当然，他的一位多年以来，一直在外交官岗位上的英国朋友朱尔典，也给予了很大的帮助。对于袁世凯的这位英国朋友，我们在后边会进一步认识。
除此，袁世凯在外务部任内，也为收回天津浦口铁路、沪杭甬铁路的路权，做出了卓有成效的努力。
分别于一九零八年订立了《天津浦口铁路借歀合同》、一九零八年三月六日签订了《沪杭甬铁路借歀合同》，把借歀和路权剥离。
津浦路是我国南北交通的大动脉，北起天津，南至浦口，路经河北、山东、安徽、江苏四省，全长一千多公里公里。始建时，计八十二个站(长淮卫等五个小站不在其内)。一九零八年动工兴修，一九一一年竣工通车。
一八九九年英国驻华公使马可独与德使秘密商妥，由两国银行团签订有关协定，合资修筑津镇铁路并联合向清**提出承筑津镇铁路的要求，获准。五月十八日清**督办铁路大臣许景澄与英德两银行团签订了《津镇铁路草合同》三十五条。五月二十一日具奏奉旨允准。合同规定：自天津经德州、济南至峄县为北段，自峄县至镇江为南段。北段和南段的建造、行车一切事宜，分别由德华银行和中英公司代为经理。
借款共七百四十万英镑，年息五厘，九折付款，以路产及营业收入作担保。自一九零一年起，四年内还清。借款还清以后，铁路才能归中国自理。并规定南北两段各设一总局，各由华员二人、洋员三人组成。草合同签订之后，由于一九零零年的义和团运动，修筑津镇路未能开工。
光绪三十三年(一九零七)四月十七日，袁世凯、张之洞电奏朝廷，请派外务部左侍郎梁敦彦与德华银行代表柯达士、英国中英公司代表濮兰德筹议修建铁路事宜获准，特派袁世凯为督办大臣与德、英银行议商。结果，争执五月，始有成议。并以直、鲁、皖、苏四省绅民的请求为由，改自天津筑至浦口，定为“中国国家天津浦口铁路”。
一九零八年元月十三日，正式签订了《天津浦口铁路借款合同》，计二十四条。仍规定分南北两段修筑，以山东省峄县韩庄运河桥为界。借款暂定五百万英镑，年息五厘，自一九一九年起二十年内分期还清。1
上海至杭州、宁波铁路。初名苏杭甬铁路。清光绪二十四年(一八九八)曾订立中英苏杭甬铁路草约，拟由英国借款代筑，路权属于英国。因为当时清廷无钱修路，为收回路权，解决无钱修路的问题，通过袁世凯的努力，改由同英国借款修路。清光绪三十四年二月，《中英沪杭甬铁路借款合同》成立，工程起点改为上海，与沪宁路相接，由邮传部出面借英款一百五十万镑。
用现在的话说就是引进外资。
还有，在袁世凯的任内，还对外务部的所有衙门进行了整顿。明确了岗位责任，无论办事的效率，人员办公的纪律，都有了明显的改观。用很多人的话说，他当外务部尚书后，外务部各方面的面貌焕然一新。
一九零八年十一月十四日、十五日，三十八岁的光绪皇帝和七十四岁的慈禧先后死去。按慈禧死前的安排，载沣的长子溥仪继承大统。
因溥仪只有三岁，载沣为摄政王。
按慈禧遗命，遇有重大事件需请示隆裕太后（光绪皇帝之妻）。
隆裕太后没有能力，也没有很强的权力欲，摄政王载沣实际上成了最高统治者。载沣是醇亲王奕譞的第五个儿子，是光绪皇帝的亲弟弟。
光绪如何地恨袁世凯，这是尽人皆知的事。
有记载，光绪常在纸上画个乌龟，写上袁世凯的名字，每天不知要用针扎多少次，以解心头之恨。
因为光绪皇帝死时只有三十八岁，正值壮年，所以他的死留下了很多说法。
第一种：慈禧知道自已即将归西天，不愿意在他死后，光绪皇帝重新掌权，派人毒死了光绪帝。
主要依据有清末给光绪看病的名医屈桂庭他的回忆录中说：“光绪在临死前三天，在床上不停地翻滚，并且不停地大叫，‘肚子疼得不得了。’脸色发暗，舌头又黄又黑，明显是中毒症状。”
根据这种说法，光绪是被毒死的，最大的嫌疑人是慈禧太后，因为她是当时最有权势、又严密控制光绪帝的、是最好下毒、最可能下毒的人。
第二种：袁世凯见慈禧一病难起，怕慈禧死后，光绪掌握实权，报复自已在戊戌变法出