按照林大鑫的命令，水师学堂海军第一舰队的编制不变，拥有8艘排水量过万吨的铁甲战列舰飞熊号、飞虎号、飞鹰号、飞狼号、飞狐号、飞豹号、飞鹿号和飞]飞熊号依然是第一舰队的旗舰，舰队指挥官为孙喜涛。
林大鑫把俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15701吨的雷贝尔托号被改名为天熊号，俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15520吨的卡里格纳诺王子号被改名为天虎号。
俘虏的意大利铁甲战列舰排水量15680吨的雷德利亚号改名为天鹰号，俘虏的意大利铁甲战列舰排水量11914吨的弗朗西斯科号改名为天狼号。
俘虏的意大利铁甲战列舰排水量12080吨的玛利亚皮亚号改名为天狐号，俘虏的日本联合舰队铁甲战列舰排水量12200吨的水凤号改名为天豹号。
林大鑫用天熊号、天虎号、天鹰号、天狼号、天狐号和天豹号这6艘铁甲战列舰组成新的第二舰队，天熊号为旗舰，原飞熊号舰长蒋晨被任命为第二舰队的指挥官。
14艘排水量超过万吨的铁甲战列舰，组成了水师学堂海军新的第一、第二2支战列舰的舰队。原来的第二舰队改名为第三舰队，改造后排水量7473吨的三隈号改名为兴隆号，排水量7630吨的熊野号改名为兴业号。它们都可以算作大型装甲巡洋舰，划归了第三舰队。
2艘在吴港造船厂缴获排水量7900吨的大型装甲巡洋舰被命名为兴和号和兴盛号，也划归给了第三舰队。使得第三舰队拥有了排水量7000吨以上的13艘大型装甲巡洋舰。第三舰队的旗舰兴海号，指挥官依然是姜辉。
水师学堂海军的前三支舰队将会做为打击海上敌人的主要力量。
新成立水师学堂海军第四舰队，抽调旅顺守备舰队排水量4568吨的中型快速装甲巡洋舰安海号，排水量2950吨的防护巡洋舰立海号，排水量3180吨的快速防护巡洋舰月海号，排水量3600吨的快速防护巡洋舰星海号，排水量2800吨的快速防护巡洋舰日海号。排水量2800吨的快速防护巡洋舰辰海号。
加上吴港造船厂缴获的2艘排水量4200吨被命名为安民号和安定号的快速防护巡洋舰，一共8艘军舰。加上16艘鱼雷艇、10艘小炮艇组成第四舰队，旗舰为安海号，指挥官为原来的旅顺守备舰队指挥官于傅。第四舰队主要负责旅顺基地的防卫。排水量6901吨的铁甲舰威海号，排水量7935吨的老式铁甲舰定海号和镇海号。加上16艘鱼雷艇，组成第五舰队。旗舰威海号，指挥官是原来第二舰队旗舰兴海号的舰长陈明。第五舰队主要负责和北洋水师本队一起守卫威海卫基地。
水师学堂海军的第一、第二、第三舰队，根据需要随时在旅顺基地和威海卫基地之间轮换，而且林大鑫还准备新建立一个海军基地，就是现在的鸭绿江省南浦港。
南浦港被当时日本驻朝鲜的占领军，利用清军战俘已经把这个港口建设完成了一部分，林大鑫准备继续建设这个优良的港口，把它做为一个军港。建立南浦基地给水师学堂海军使用。
随着水师学堂海军舰队的规模越来越大，旅顺基地和威海卫基地已经不够海军使用的了。
除了上面的5支舰队，水师学堂海军还有由刺刀号和尖刀号组成的潜艇分队。
然后林大鑫还给水师学堂内的定北军新兵训练营下达命令。让新兵训练营内完成新兵训练的定北军新兵，直接坐着运输船到东北四省去，补充在东北的几个定北军整编师的损失。
定北军的新兵训练营一直有各地的青年来报名参加定北军，而且林大鑫因为鸭绿江省的朝鲜族青年也踊跃报名参加定北军，林大鑫在朝鲜的平壤设立了一所临时的新兵训练营，所以现在林大鑫手下有许多可以补充到定北军各整编师的新兵。
在和日军南路军作战受到不小损失的几个定北军整编师。没有用多长时间，就补充进了大量的新兵。使得几个受损的整编师重新达到了满编状态。
在朝廷还没有任命林大鑫为东北四省总督，他就已经开始让在威海卫的定北军第五师，和新编的定北军第十三师、第十四师、第十五师，4个师的派出官兵，到山东以及附近的省份，宣传林大鑫东北的移民政策，护送愿意移民东北的各地百姓，到威海卫坐船去东北。
反正林大鑫不管朝廷是什么态度，东北四省以后就是他林大鑫的地盘了！
在大清与日本的战争中异军突起的林大鑫，已经引起了世界上各大强国的重视，都知道在远东古老的清帝国出现了一名军事强人，他现在不但占据了近百万平方公里的疆域，而且还拥有一支排水量超过30万吨的强大舰队，和一支战斗力强悍，拥有许多先进武器的近30万新式陆军。
在一些外国的报纸上，有关于林大鑫的报道，都称呼林大鑫为远东军事强人。
崛起的林大鑫甚至引起了某些国家的惊恐，其中和大清朝比邻的沙皇俄国，就对林大鑫有了非常大的警觉。
从大清建立后，俄罗斯帝国在大清身上侵占了很多土地，1689年的“尼布楚条约”本来号称是平等条约，但清政府代表在与俄国代表谈判时，一再退让。
在尼布楚会议上，清朝代表曾提出以勒拿河至北冰洋为界的第一方案。俄国不同意后，继而让步提出第二方案，即以外兴安岭的北支（诺斯山）直至亚洲大陆最东北的没入大海深处的诺斯海岬（即楚科奇半岛）为界