数万流民，分了孔府的粮食，劫了曲阜的县库，杀了县令和孔家一百多成年男丁，然后就散了活，而且散的很彻底。这样的事情，一看就是有组织的行动。
但是陈燮在奏本中写：贼闻大军至，散而走之，待臣至曲阜，贼走一空。念民生之苦，刀斧相加，恐激起更大之民变。臣已就近调集粮食，抚恤饥民，不使再变。此事因臣视察不细而起，故请辞山东巡抚一职。
济南方面的奏折先一步到了京师，内阁立刻送到朱由检跟前。张秉文、宋光兰联袂上奏，东昌、兖州二府，奸商与文武官员勾结，沆瀣一气，盗卖库粮，罪大恶极。事情败露，自戕者有山东都指挥使、兖州分守道、兖州知府、济宁知州、任城卫指挥使、济宁守备。
这些人自杀的原因，其实不是盗卖库粮，而是因为衍生民变，导致孔府被毁。这三个罪加起来，肯定没救了。看看东昌府，不就没有自杀的官员么？百姓没闹起来就没事。
奏折中还强调了，青州府、莱州府、登州府、济南府，这四个府一切太平。东昌府流民在省城及时运粮赈济之后，也恢复了平静。夏收即将开始，山东之乱无虞。
如何处置山东官员，内阁里分了两-一-本-读-小-说-派，一派是孔贞运为代表，要求严惩山东官员。为首者陈燮、张秉文、宋光兰，更要严惩。不过孔贞运一个人闹腾没用。温体仁等人则认为，陈燮事先有视察旱情，要求各府做好准备，成果是不错的。关键是地方官员欺瞒，联手作假，陈燮短期视察，很难能看出端倪。当前大局之下，还是下旨斥责为上。
就是说，眼下够乱了，就不要再生事端了。陈燮是什么人？你当他是软柿子啊？他手里有兵。大明最能打的兵。你撤他的职，还能怎么地？难不成派人去抓他？要去你去，我们不干。再说，这事情算在陈燮的头上。也不合适。陈燮顶多是个领导责任。斥责两句就行了。
朱由检很自然的偏向了陈燮。这个没啥好说的。东昌的奏报，先一步上来了。对不之后发现，两边说的差不多。说明陈燮没有欺君。这事情还没定论，陈燮的奏折也到了，一看陈燮请辞，孔贞运又来劲了。这位阁老，平时没啥言语，那是被温体仁压的狠。现在事关孔家，虽然他是江苏人，但架不住他姓孔啊，有理由发言。
山东的事情，内阁里争议不休，朱由检也在犹豫。朝臣弹劾海也来了，都是奔着山东群臣去的。不止一个陈燮，这是要山东官场灭团的架势。很自然地，反对的一方开始还击，谁当官没几个同年座师来着？开始吵，朝会上吵，散朝了弹劾吵。
有趣的是，这些人吵架的范畴，其实就两个字“责任”。丝毫没人去提，山东旱情如何，灾民安置如何。就是在咬着民乱孔家被破一事，王八咬人不松口。
文臣吵架，朱由检心里很不爽。为啥？很简单，山东的奏折又来了，这一次更具体。调集了多少粮食，安置了多少灾民，兖州府的乱局被控制住了，目前没有再闹腾的意思。
争吵了一个月，陈燮在兖州就呆了一个月。连续十几份奏折，没有一份是自辩的。都是开口称，臣有失察之罪，然后说具体的都在干啥。审问官员，查明案情，打击奸商，罚没粮食多少，罚金多少。一笔一笔的账目非常清楚，这是在真真的做事的态度。
又一天的早朝，文官们还在两边对喷的时候，朱由检忍不住了。拍着龙椅站起，抬手指着在台下吵架的官员们，怒喝：“你们在这里互相攻讦，可知山东地方正在忙于安顿流民，挽救夏收，避免类似的事情再发生？你们可知道，山东从各地调来多少粮食？你们可知道，陈思华在兖州呆了一个月，忙着安抚地方，上的奏折里，一个字都没为自己辩护？你们可知道，陈思华收缴赃款，对奸商开出罚金单子，所得白银五十余万，山东地方不留一两，全部押送进京，交给朕来处置？陈思华在山东，为地方稳定殚精竭力，你们呢？可有一实策？”
这一通骂的，下面的文臣们目瞪口呆，完全没有反应过来，朱由检拂袖而走。吵了一个月的事情，终于落下了帷幕。内阁以前所未有的效率，票拟一则，交司礼监披红下发。
具体内容为，兖州之事，巡抚、布政司、按察司，皆有失察之责。念彼等处事果断，善后及时，不以重责。暂时留任，以观后效，再有事发，两罪并罚。都指挥使毛xx，兖州分巡道，罪有应得，死有余辜。人虽死，不能脱其罪，责成山东地方抄家，女眷充为官妓。
这么一个处置，山东官场要员们，除去自杀的都指挥使，其他人毛都没掉一根。这样的处置结果，山东地方自然弹冠相庆，总算是保住了自己的饭碗。
陈燮从兖州回来，看见这个处置结果之后，还是上奏一份，称：一干以死逃罪者，念其尚有羞耻之心，抄家、罚金即可，女眷发还祖籍，可彰君父之德。
这一份奏折到了京师，再次掀起轩然大波，文武百官意外众口一声，支持陈燮的建议。朱由检看在抄家罚金的面子上，思之再三，勉强同意了这个建议。于是百官纷纷上奏，称颂君父之德，不亚尧舜。并恳请，今后非谋反大罪，皆效此例。
赶上五十万的银圆的汇票到手，听说山东地方恢复了平静，心情大好的朱由检，意外的同意了这次建议。并表示，有司可设条例，以待日后有据可查。意思