赤木律子的话让自己的母亲觉得很不可思议，她怎么也没想到自己的女儿会说出这种让人啼笑皆非的问题来，神？
这个世界在很久很久以前也许真的有‘神’的存在，但在赤木直子看来那所谓的‘神’也和传统意义中的不同，莉莉丝，亚当，使徒，难道他们对人类来说还不算神吗？也许不算吧，他们也许只是另一种高等生物？
对于‘人类补完计划’，赤木直子知道的并不多，她知晓的情报其实很有限，虽然她是seele的成员，但她还没有达到那种知道一切的级别，如果她知道seele的高层想要做什么的话，也许就会相信这个世界有神的存在，亚当，莉莉丝，使徒也并非是‘外星’生命。
其实不管是赤木直子所研究的超级计算机，又或者是碇唯研究的a10神经，再到eva的制作，都只是在围绕一个计划而进行，最终的目地就是进行‘人类补完’，不管是seele的高层，还是碇源堂都是以这个目地而努力，只不过双方所要的结果并不相同。
尽管只有一个‘人类补完计划’（将人类从原罪中解救出来的计划），但是碇源堂和seele却同床异梦。
不过，至少在寻找生命之树这一点上还是一致的，而关于如何找到生命之树就能进行赎罪仪式并让全人类回归到原始状态的过程，都记载在《死海古卷》不为人知的另一面中。
按照这一人类赎罪的‘剧本’，要接近生命之树必须打倒神所安排的守护者，也就是使徒。
但实则却有些不太相同，其实seele也好，就算是原本有着撒旦身份，现在却变诚仁类的碇源堂也好，他们有一件事却不知道，那就是生命之树的守护者并非是在大战中幸存下来的天使，而是先封印，再被分裂，最后变成胚胎，苦逼哈哈的亚当。
幸存下来的使徒，她们的目地是将苏醒后的神给消灭，并非看守生命之树，在这点上就算是莉莉丝也把撒旦给骗了，她没有去听从撒旦的安排保护生命树，不是她不想，而是她没有这个能力，在她以及剩下的天使，用撒旦的身体做成封印将神和亚当封印起来后，生命树也从这个世界消失，至于跑到什么地方莉莉丝也不知道，她寻找过生命树的下落，但一无所获。
在雷哲被封印瞬间，他就明白莉莉丝和撒旦必然会寻找伊甸园中的生命之树，所以他动用自己的权力将生命树改变形态，最终封印在亚当的体内，这种做法一是保护亚当，二是不想让莉莉丝和撒旦的阴谋得逞，因为在这个世界，生命树就是‘世界意识’，类似《反叛的鲁鲁修》中，雷哲曾经掌握的东西。
如果自己被封印，而莉莉丝和撒旦又得到这东西，雷哲觉得自己真的会暴走，就算解除封印后他也会忍不住把这个世界给拍死，毕竟被封印他只是看作倒霉，可如果就连自己的世界都被别人抢走，那他就有点被打脸的感觉。
对于亚当，雷哲对他的感情不好不坏，在雷哲看来亚当就是个老好人，不愿意与别人发生争执，总是笑眯眯的，没有什么太大的毛病，不怎么习惯和人交流，如果可以他宁愿躲在某处睡上几万年。
而在亚当第一任妻子莉莉丝看来，亚当就是个不会与人交流的自闭儿，而且很无聊，除睡觉外就不知道该做什么，这种人起初还不觉得有什么不好，但时间久了，必然会觉得寂寞，否则莉莉丝也不会离开伊甸园，跑到地球邂逅撒旦。
不过有句老话说的好，越是老实人，发怒起来越可怕，在后来的战斗中这个有些内向自闭的男人，就给雷哲造成不少的麻烦，甚至最后还拖住雷哲，给莉莉丝制造出机会，雷哲暗骂亚当这混蛋脑袋被驴踢了，莉莉丝都把你甩了，你还为对方卖命，实在让哥们吐槽不能，你丫到底要多傻才能做出这种事情。
在这种郁闷的心态中，雷哲和亚当被封印在一起，这些年来雷哲最想说的话就是：“老子不搞基，下次再封印哥们，找个妹子可以么…”
解读《死海古卷》是eva中虚构了一设定，死海古卷缺少了相当的一部分，而那上面就记载着关键的有关出现生命之树的情报。
此外，还需要找到隆基努斯之枪和加福之所——希伯莱神话中住着天神之魂魄的地方，准备出生到人间的孩子们，会首先在那里获得灵魂，而当这里的门打开时，也就打开了世界的开始和终结之门。
在这里所说的加福之所，就是封印雷哲和亚当的地方，也就是所谓的‘白之月’，而剧情中所指的‘孩子们’并非是后来的eva的驾驶员，比如说碇真嗣，明曰香等人，而是在第二次冲击当曰诞生的第十七使徒，渚薰。
在这个世界的渚薰和原作有着绝对的不同，在他诞生当时，雷哲也出现过在他的面前，而让雷哲出乎意料的是，这个渚薰有着很多让他也惊讶的地方。
后面的事情就跟上述的差不多，白之月的封印被打开，被封印中的神苏醒，亚当苏醒，为此打开世界的开端和终结之门，第二次冲击所引发的能量冲击只不过是一点点彩头。
第二次冲击：为了消灭使徒的生命之源亚当之卵（白之月），必须使用隆基努斯之枪——拥有回归原始之里的存在。
但是，在2000年南极的实验中，由于使徒的基因与人的遗传基因的接触，释放出了超出预想值以外的反at力场（智慧之果和生命之果结合时就会产生和神同等的力量）。
结果