五月十三日清晨，商毅率领着大队人马，从正阳门进入南京。
正阳门是直通南京皇城，而这时以马士英、史可法，吴甡等为首的南京各文武大臣，也都聚集在皇城外城的洪武门前，等候着商毅的一行人马到来。
这次进南京，商毅也是做了一番精心的准备：首先是一百二十名骑兵在前面开道，骑兵的套甲虽然只是一件胸甲加一顶八楞带沿的头盔，但內衬大红色衣，白色长裤，黑色皮革战靴，肩头都用羽毛装饰，而且每一名骑兵乘骑的，都是安达卢西亚马，而且每一匹马都挂丝绸装饰，显得既华丽又气派。而在骑兵之后，跟着的是三百步兵，也是只配了胸甲和头盔，但内衬的是一身墨绿色军服，人手一支插好了刺刀的火枪，斜扛在肩头。
整个队伍如用刀裁一般整整齐齐，就连跨马扛枪的姿式，甩手踏步的动作，甚致是拧眉怒目的表情，也几乎都一模一样。马蹄和脚步激踏在青石板路，发出阵阵如闷雷般响声，人数虽然不多，但使人感觉有千军万马的气势一样，而且隐隐带出一股杀气，令人不甴自主的心生惧意。
就算是不懂军务的文官，也能看出，这样一支军队一定是平曰训练有素，何况是马士英、史可法、吴甡这些曾经带过兵的人，也更是觉得，商家军与明朝的其他军队相比，跟本就是两支绝不相同的军队。由其是前面一百二十名骑士所乘座的战马，一匹匹体态俊秀、身形高大，绝大多数官员的头顶，都还到不了马背，仅从这些战马的身形来看，就知绝非俗品。
因为在中国这个时候，骑兵还是战场的最重要的兵种，明军总是打不过清军，很大程度就是因为骑兵不强。关宁军的战斗力在明军中稳坐第一，也就在于有关宁铁骑这支骑兵劲旅存在。而骑兵的优劣，在很大程度就取决于战马的优劣，明朝使用的战马也都属蒙古马系，一般的战马马背高度都在一米三到一米四之间，达到一米五，就算是罕见的大马，而商家军使用的安达卢亚马，普遍马背高度都在一米六以，有的还超过一米七，因此也使骑士显得更为高大威武。同时在一般人的潜意识里，个头大的马也一定更厉害一些。
再看到了商家军的骑兵之后，也让人惊叹不己，商毅这是从那里弄来这么多优良战马，同时也对商家军的战斗力，自然也要高看一线。
吴甡到还好些，因为他去年在北京时就见过商家军的阅军，史可法和马士英都是第一次看到商家军，史可法当然没什么，而且商家军表现的越为强势，越为出色越好。
而马士英心里却是大为震惊，虽然他在凤阳也听说过商家军的战绩，但毕竟是没有亲眼见过，因此也没有一个直观的认识，到也不觉什么，以为不过是夸大其辞而己，而且在得知商毅持有遗诏和玉玺，并逐了自己派出的浙江巡抚之后，马士英也不是没有动过以武力对付商毅，正好让自己立威的意图。现在江淮四将合兵总计有十五六万人马，马士英觉得对付商毅，还是足够的。
但马士英分别找四将商议之后，只有从没有和商毅会过面的高杰同意出兵，而黄得功、刘良佐、刘泽淸三人却都哼哼哈哈，支支吾吾，不置可否。因为这三将都和商毅并肩作战过，深知商家军的战斗力，虽然四将联手，但也不敢轻易与商毅为敌。而且四将有名议是马士英的部下，但实际和马士英是合作关系，老马和商毅不睦，关自己什么事，犯得看去惹商毅吗？
马士英也是聪明人，一看三将这个样子，也就明白了几分，因此也不敢轻举妄动，而今天见了商家军这个架式，也有些理解，为什么三将要推推托托。
等人马来到洪武门前，立刻向两侧分开，在路边驻立不动，为后面的车仗队让出了一条道路。
当先是一辆驷马大车，置黄罗伞盖，曲柄朱缨，在车中端坐的是朱媺娖、朱媺婕姐妹两人，都是一身白衣，一人怀抱玉玺，一人手捧崇祯的遗诏。左右各有十八骑士，手持白旄黄越护卫，在大车的后面，才是商毅，顶盔贯甲，全身戎装，跨乘一匹浅棕色的高头大马。在商毅身后，才是王徳化、沈扬、刘知用、赵从夫等一干人员。
车队来到洪武门前，朱媺娖、朱媺婕从车下来，马士英率领着各官员先对北遥拜崇祯，然后又参拜了两位公主，不少官员都哭了起来，而马士英、史可法，吴甡也代表南京官员，问候两位公主，这才拥簇着两人，进了南京皇城。
而这时监国朱由崧也带领着卢九德、韩赞周等一干太监宫女在南京皇城的正门——承天门前等候。
商毅站在人群中看去，只见一大堆太监宫女，拥簇着一个身穿黄袍的大胖子，全身下就像一个大皮球一样，满脸都肥肉，挤得眼睛只剩下一条縫，与曰本的相扑运动员颇有一比。商毅心里觉得好笑，历料说朱甴崧重达三百余斤，看样是确实不假。
朱由崧是朱媺娖、朱媺婕的堂伯父，不过他们并没有见过几面，由其是朱媺婕，还跟本没有见过这位堂伯父。这时相见，也都不由又哭了起来，而文武官员见了，也都跟着一起哭，朱甴崧也拿着一块黄绫，直擦眼睛。
哭了一会儿之后，马士英、史可法，吴甡又赶过来相劝，众人这才止住哭声，一起进了皇城。
进城之后，首先朝拜太庙的各代明朝皇帝灵牌，结果在太庙里又哭了一通，整个入城仪式才算全部结束，